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Beim Western Blot werden Proteine durch eine etwas andere Elektrophorese (PAGE) aufgetrennt und auf die Membran übertragen.Analog zum Southern Blot gibt es auch einen Northern Blot. Hier wird RNA durch Gelelektrophorese aufgetrennt und auf eine Membran übertragen. Mit dem Northern-Blot kann der Expressionsstatus eines Gens überprüft werden. Als Sonde dienen hier spezifische Antikörper.
Funktionsweise
Alle unspezifischen Bindungen werden anschließend abgewaschen. Das im Gel entstandene Trennmuster wird auf eine Membran (meist nylon oder Nitrocellulose) übertragen und dort dauerhaft fixiert.Die zu untersuchende DNA wird mit einem oder mehreren Restriktionsenzymen behandelt und anschließend durch Gelelektrophorese der Größe nach aufgetrennt.
Anschließend wird die Membran mit einer chemisch oder radioaktiv markierten Gensonde behandelt. Diese Sonde besteht aus einzelsträngiger DNA, welche zur gesuchten Sequenz komplementär ist. Befindet sich diese Sequenz irgendwo auf der Membran, so bildet die Sonde Basenpaarungen aus und bindet dauerhaft in diesem Bereich. Die Detektion erfolgt durch Auflegen der Membran auf Röntgenfilm, Fotopapier oder Phospho-Imager–Platten.
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